Genomski pokretači progresije i organotropizma u metastatskom karcinomu bubrega: analiza kohorte MSK-IMPACT

Metastatska bolest odgovorna je za preko 90% smrti od raka, ali genomske determinante koje određuju koji primarni tumori će metastazirati i u koje organe i dalje nisu dovoljno razjasnjene. Karcinom bubrega (RCC) je posebno pogodan model za ovu vrstu analize: pokazuje izrazito stereotipne obrasce diseminacije (pluća, kosti, mozak, jetra, limfni čvorovi) i ima dobro definisan skup driver/pokretačkih gena: VHL, PBRM1, BAP1, SETD2, KDM5C, MTOR. Projekat će koristiti nedavno objavljenu MSK-IMPACT 50K kohortu (cBioPortal studija msk_impact_50k_2026; Zenodo doi 10.5281/zenodo.18445440), javno dostupan skup podataka sa ciljano sekvenciranim tumorima 48.179 pacijenata i anotiranim metastatskim događajima. Iz ovog skupa provesti dvije komplementarne analize: (1) Ko-pojavljivanje driver mutacija u funkciji metastatskog opterećenja. Testirat će se hipoteza da se obrasci ko-mutacije i mutualne ekskluzivnosti razlikuju između pacijenata bez metastaza (M0), oligometastatskih (1–2 zahvaćena organa) i polimetastatskih (3+ organa) slučajeva, to jest, da li specifične genomske konfiguracije omogućavaju širu diseminaciju. (2) Atlas organotropizma RCC stratificiran prema molekularnom statusu. Za svaki organ (pluća, kosti, mozak, jetra, limfni čvorovi, itd.) izračunat će se vjerovatnoće metastaze date stanjem driver gena te indikatorima hromozomske nestabilnosti (frakcija izmijenjenog genoma). Rezultati će se uporediti s nalazima iz nezavisnih kohorti opisanim u literaturi.